杯果木CCR基因克隆和同源进化分析

时间:2023-04-26 19:17:54 工业农业论文 我要投稿
  • 相关推荐

杯果木CCR基因克隆和同源进化分析

从粗毛杯果木和软叶杯果木基因组中克隆CCR基因,经测序验证扩增片断长度均为2321 bp,包含部分外显子3、4和部分5,以及内含子3和4.同源性比较分析表明:租毛杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%~87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到97%~84%;而软叶杯果木与伞房属树种CCR的同源相似性达到98%~87%,与桉属树种CCR的同源相似性达到95%~84%.总体上,该2个杯果木树种与伞房属CCR同源相似性较高,而与桉属CCR同源相似性较低.3个属中最长保守序列位于Exon5的第3147~3175位点,共29个碱基.保守区域主要集中于Exon 5,少数于Intron4.桉属总变异率大于杯果木属和伞房属.桉属Exon 4变异率大于属内其它Exon或Intron;同样发现Exon 4的简约信息位点百分数大于属内其它Exon或Intron,但杯果木属中的Intron 3变异率高于属内其它Exon或Intron.伞房属以Exon 5的变异率最高.Exon或Intron平均变异率均以桉属最多,其次是杯果木属,最少的是伞房属.使用MEGA3.1软件构建的CCR进化树表明,桉属、伞房属和杯果木属分别形成单系,其亲缘关系可以明显区分开来.杯果木属最早产生分歧,并形成单独一个分枝;其次是伞房属,也形成单独-个分枝,进化较杯果木属迟;最迟进化的是桉属,也形成单独一个分枝.这种结果与形态学比较接近,易为人们所接受.

作 者: 陈碧华 CHEN Bi-hua   作者单位: 福建省林业科学研究院,福建,福州,350012  刊 名: 桉树科技  英文刊名: EUCALYPT SCIENCE & TECHNOLOGY  年,卷(期): 2009 26(1)  分类号: S792.39  关键词: 粗毛杯果木   软叶杯果木   CCR基因   基因克隆   同源性   分子进化  

【杯果木CCR基因克隆和同源进化分析】相关文章:

英语同源副词的区别05-04

塑料杯和玻璃杯作文12-08

考研英语同源阅读时文精选04-27

英语同源形容词的区别05-04

我和世界杯作文07-20

我和世界杯作文02-20

进化风波作文08-08

人类的进化作文12-13

关于生物的进化的教案08-26

《生物的进化》教学反思04-04