暗纹东方鲀线粒体COI及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析

暗纹东方鲀线粒体COI及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析

以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方鲀线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定了线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆了暗纹东方鲀COI基因1 546 bp及其5′端上游的tRNATyr基因和3′端下游的tRNASer基因序列共1 766 bp.用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中10个目14种鱼类的COI序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的COI基因具有较高的同源性,与同属红鳍东方鲀的同源性最高为97.6%,与同目不同科的矛尾翻车鲀和翻车鲀的同源性为76.5%和75.4%.根据暗纹东方鲀与其他1 314种鱼的COI基因序列同源性所建立的进化树,与传统的分类地位基本吻合.推定的这两种tRNA的二级结构都具有典型的三叶草型结构.

作 者： 邵爱华 朱江 陈葵 史全良 姚炜雯 SHAO Ai-Hua ZHU Jiang CHEN Kui SHI Quan-Liang YAO Wei-Wen   作者单位： 邵爱华,SHAO Ai-Hua(江苏省苏州大学生命科学学院,苏州,215123;江苏省苏州科技学院生物学系,苏州,215009)

朱江,陈葵,史全良,姚炜雯,ZHU Jiang,CHEN Kui,SHI Quan-Liang,YAO Wei-Wen(江苏省苏州大学生命科学学院,苏州,215123) 

刊 名： 遗传  ISTIC PKU 英文刊名： HEREDITAS(BEIJING)  年，卷(期)： 2006 28(8)  分类号： Q95  关键词： 暗纹东方鲀   线粒体DNA   COI   系统学  

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