拟南芥和线虫外显子/内含子剪切位点的研究

拟南芥和线虫外显子/内含子剪切位点的研究

将拟南芥(A.thaliana)和线虫(C.elegans)的基因序列中的外显子按第一外显子,中间外显子和最后外显子划分成三类.分别将外显子/内含子剪切位点、翻译起始和终止位点附近的三联体的3个位点作为3条子链,以各条子链的不同碱基个数作为离散源参数,共12个离散源参数,计算各类外显子离散量.用离散增量实现了对三种序列类型的预测,预测成功率都达到80%以上;并且统计了剪切位点附近的碱基相对频数,结果比较了由于三联体所取位置及个数不同而造成的对预测结果的差异,说明了剪切位点附近碱基的保守性.

作 者： 林昊 李前忠 LIN Hao LI Qian-zhong   作者单位： 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021  刊 名： 内蒙古大学学报（自然科学版）  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NEIMONGOL  年，卷(期)： 2006 37(3)  分类号： Q61  关键词： 外显子   离散增量   剪切位点   保守性  

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