猪T细胞受体γ链基因的克隆及生物信息学分析

猪T细胞受体γ链基因的克隆及生物信息学分析

目的:克隆猪T细胞受体γ链(pTCR-γ)基因,用以研究猪T细胞受体分子结构与功能.方法与结果:以GenBank上登载的pTCR-γ基因为参考序列,用RT-PCR法从猪外周血淋巴细胞中克隆pTCR-γ基因.序列分析表明,pTCR-γ基因开放读框为1026 bp,编码341个氨基酸残基,合有由23个氨基酸残基构成的信号肽序列;与参考序列相比,在核苷酸和推导氨基酸序列上的同源性分别为95.6%和88.8%;系统进化分析发现,该基因与绵羊、恒河猴、人、马、牛的同源性相对较高,与褐鼠、家犬、家鼠、家猫的同源性次之,而与禽类、鱼类的同源性最低;生物信息学结构预测表明猪T细胞受体γ链含2个结构域,其中1个为IG_LIKE1结构域(IGv结构域),由第14～114位共101个氨基酸残基组成;另一个为IG_LIKE2结构域(IGc结构域),由第143～238位共96个氨基酸残基组成.结论:克隆并应用生物信息学技术分析了猪T细胞受体γ链基因序列及编码蛋白的结构特征,为进一步研究γ链的结构与功能奠定了基础.

作 者： 李玩生 房永祥 曾爽 景志忠 LI Wan-Sheng FANG Yong-Xiang ZENG Shuang JIHG Zhi-Zhong   作者单位： 中国农业科学院,兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部兽医公共卫生重点实验室,甘肃省动物寄生虫病重点实验室,甘肃,兰州,730046  刊 名： 生物技术通讯  ISTIC 英文刊名： LETTERS IN BIOTECHNOLOGY  年，卷(期)： 2010 21(2)  分类号： Q78  关键词： 猪T细胞受体γ链   基因克隆   生物信患学   结构预测  

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