图论在RNA二级结构中的应用

图论在RNA二级结构中的应用

图论是以图为研究对象的数学分支,是一门研究事物对象在图表示法中的特征与性质的学科.鉴于RNA二级结构在功能基因组研究中的重要地位,已发展了用二维图解表示法描述RNA二级结构.文章介绍了用于RNA二级结构图解表示法的两种图,即树图和对偶图的构造规则.并在树图表示基础上产生Laplacian矩阵和相应本征值谱.以有害突变预测和类RNA模体设计的例子,说明图论在RNA二级结构中的应用,同时对可能存在的一些问题做了讨论.

作 者： 周文彦 曹槐 ZHOU Wen-yan CAO Huai   作者单位： 云南大学现代生物学研究中心,昆明,650091  刊 名： 生物信息学  ISTIC 英文刊名： CHINA JOURNAL OF BIOINFORMATICS  年，卷(期)： 2008 6(3)  分类号： Q111  关键词： 图论   RNA二级结构   树图   对偶图   Laplacian矩阵本征值  

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