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采用SEREX方法从cDNA表达文库中筛选大肠癌抗原基因
目的 寻找人源性大肠癌特异性抗原基因.方法 采用SMART技术构建人大肠癌组织来源的eDNA噬菌体表达文库,以自体或异体大肠癌患者血清按SEREX方法进行免疫筛选,对平板法扩增获得的阳性克隆片段导人克隆载体PUCm-T后进行测序、鉴定和BLAST同源性比较,并根据cDNA序列进行生物信息分析.结果 构建了3个大肠癌抗原cDNA噬菌体表达文库,其滴度分别为2.39×106 pfu/mL、2.07 × 106 pfu/mL和1.86×106 pfu/mL,插入片段长度为0.5~4 kb,平均分别为1.4、1.6和1.3 kb,重组率最高达到97.5%.选择高滴度文库扩增后滴度达到4.1×1010 pfu/mL.SEREX筛选共获得16个阳性克隆,代表12个不同抗原基因,其中10个基因片段为已知抗原基因,如IFITM1、CD24、Survivin、KLK6等,2个为未知EST片段.根据序列分析,筛选出的抗原基因有结构基因、调节基因、代谢相关基因等.结论 利用SEREX方法筛选出大肠肿瘤相关抗原基因并获得2个肿瘤抗原候选基因.
作 者: 肖冰 刘宇虎 何敬东 赖卓胜 张振书 XIAO Bing LIU Yuhu HE Jingdong LAI Zhuosheng ZHANG Zhenshu 作者单位: 南方医科大学南方医院消化科,广东,广州,510515 刊 名: 胃肠病学和肝病学杂志 ISTIC 英文刊名: CHINESE JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY AND HEPATOLOGY 年,卷(期): 2008 17(4) 分类号: Q343.1 关键词: 结直肠肿瘤 血清学筛选技术 抗原基因 cDNA表达文库【采用SEREX方法从cDNA表达文库中筛选大肠癌抗原基因】相关文章:
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