人SBK1 cDNA的克隆及其相互作用蛋白的筛选

人SBK1 cDNA的克隆及其相互作用蛋白的筛选

首次克隆到人的SBK1(homo sapiens SH3-binding domain kinase 1,SBK1)的cDNA序列,并通过生物信息学的手段,电子克隆到人SBK1的基因组DNA序列.人的SBK1是鼠SBK1的直系同源物,两者基因组DNA结构相似,均含有4个外显子.人的sbk1基因ORF长1 275 bp,编码424个氨基酸,而鼠的ORF长1 254 bp,编码417个氨基酸.两者编码区的核苷酸序列同源性达87.7%,而氨基酸序列同源性达95.7%,在羧基端均有一个PV富集区,推测其能与含有SH3结构域的蛋白质结合.将RT-PCR所获得的长度为1 610 bp的sbk1 cDNA序列搜索EST数据库,进行电子延伸,最终获得了约5kb的人sbk1全长mRNA序列,它与鼠的sbk1全长mRNA大小一致;通过比较基因组学发现UniGene族Hs.97837实际上代表了sbk1基因UniGene族Hs.460471的3'UTR区域,而不是代表了一个新的UniGene族.采用酵母双杂交技术,以SBK1为"诱饵",获得了与之相互结合的蛋白表皮生长因子受体EGFR和核孤儿受体蛋白NR4A1,它们之间的具体功能关系有待进一步研究.

作 者： 王平章 王欣 王峰 吴俊 WANG Ping-Zhang WANG Xin WANG Feng WU Jun   作者单位： 王平章,王峰,WANG Ping-Zhang,WANG Feng(国家人类基因组北方研究中心,北京,100176)

王欣,WANG Xin(中国医学科学院基础医学研究所,北京,100005)

吴俊,WU Jun(国家人类基因组北方研究中心,北京,100176;上海睿星基因技术有限公司,上海,201203) 

刊 名： 中国生物化学与分子生物学报  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY  年，卷(期)： 2006 22(4)  分类号： Q71  关键词： SBK1   克隆   酵母双杂交   相互作用  

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