基于β-微管蛋白基因部分序列探讨灵芝属菌株的亲缘关系

基于β-微管蛋白基因部分序列探讨灵芝属菌株的亲缘关系

PCR分别扩增了38个灵芝属菌株的β-微管蛋白基因片段,并对PCR产物进行序列测定,得到419bp的一段核苷酸系列.根据MEGA 2.1软件中的neighbour-joining methods对上述序列进行聚类分析,结果所有供试菌株被分成9个聚类组.中国栽培灵芝菌株分布于6个聚类组,其中树舌亚属、紫芝组的菌株各自聚成一组,灵芝组的菌株分成四组,但大部分灵芝组菌株均聚于同一组, 这表明树舌亚属、紫芝组和灵芝组间的遗传差异较大,灵芝组内虽然存在着一定的遗传差异,但总体上亲缘关系比较近,遗传多样性并不丰富.同时,序列分析的结果显示,β-tubulin基因序列在第三位密码子和内含子部位有高的碱基替换率,这些变异提供了丰富的系统发育信息,提示β-tubulin基因适合于灵芝属菌株的亲缘关系研究.

作 者： 苏春丽 唐传红 张劲松 潘迎捷 SU Chun-Li TANG Chuan-Hong ZHANG Jing-Song PAN Ying-Jie   作者单位： 苏春丽,SU Chun-Li(南京农业大学生命科学学院微生物系,南京,210095;上海农业科学院食用菌研究所,上海,201106)

唐传红,张劲松,TANG Chuan-Hong,ZHANG Jing-Song(上海农业科学院食用菌研究所,上海,201106)

潘迎捷,PAN Ying-Jie(上海水产大学,食品科学学院,上海,200090) 

刊 名： 菌物学报  ISTIC PKU 英文刊名： MYCOSYSTEMA  年，卷(期)： 2006 25(3)  分类号： Q94  关键词： 序列分析   neighbour-joining methods   聚类分析   遗传多样性  

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