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Λ-、Δ-[Rh(bpy)2chrysi]3+对含C:T错配的DNA序列识别作用的分子模拟研究
通过分子模拟方法研究了手性金属配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+ ( bpy=2,2'-bipyridine; Chrysi= 5,6- chrysenequinonediimine )对包含C:T 错配碱基对的B-DNA序列的识别作用.结合类似的针对含G:A错配的和正常的B-DNA序列的识别作用研究,发现配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+可以对错配B-DNA序列进行序列特异性的识别.能量对比计算结果表明,该经典插入识别作用倾向于在错配碱基对附近进行,其中Δ - [Rh(bpy)2chrysi]3+比其手性异构体更占优势.这同Barton教授工作组的实验结果是一致的.另外插入作用倾向于在错配序列中的正常双碱基对C3A4/G3T4(错配碱基对附近)中从小沟进行.与该配合物对含G:A错配的和正常的B-DNA序列的识别作用不同的是,对包含C:T 错配碱基对的B-DNA序列的识别作用倾向于从小沟进行.这一点可能源于C:T碱基对结构的不同.
作 者: 熊振海 杨频 XIONG Zhen-hai YANG Pin 作者单位: 熊振海,XIONG Zhen-hai(山西大学分子科学研究所,分子生物学和分子工程教育部重点实验室,山西,太原,030006;上海交通大学化学化工学院,上海,200240)杨频,YANG Pin(山西大学分子科学研究所,分子生物学和分子工程教育部重点实验室,山西,太原,030006)
刊 名: 分子科学学报 ISTIC PKU 英文刊名: JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCE 年,卷(期): 2006 22(3) 分类号: Q52 关键词: 分子模拟 ESFF C:T错配DNA 金属配合物【Λ-、Δ-[Rh(bpy)2chrysi]3+对含C:T错配的DNA序列】相关文章:
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