一种快速比较蛋白质结构预测模型相似性的方法

一种快速比较蛋白质结构预测模型相似性的方法

根据相同立体结构中的各部分只需一个旋转矩阵就能将两者叠合在一起的基本原理,对原有的结构比较方法作了改进,使其比较速度得到很大提高.尤其是对相似蛋白质结构的比较,速度的提高更为显著.由于在蛋白质天然构象的一致性分析中,模型结构之间的比较是其计算时间的瓶颈,因此本法对提高一致分析方法的计算效率有着重要的意义.

作 者： 徐建平 方慧生 相秉仁 XU Jian-ping FANG Hui-sheng XIANG Bin-ren   作者单位： 徐建平,相秉仁,XU Jian-ping,XIANG Bin-ren(中国药科大学分析测试中心)

方慧生,FANG Hui-sheng(中国药科大学生命科学与技术学院,南京,210009) 

刊 名： 中国药科大学学报  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF CHINA PHARMACEUTICAL UNIVERSITY  年，卷(期)： 2006 37(3)  分类号： Q518.2  关键词： 蛋白质结构预测   旋转矩阵   蛋白质模型比较  

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