不同16S rDNA靶序列对DGGE分析活性污泥群落的影响

不同16S rDNA靶序列对DGGE分析活性污泥群落的影响

摘要： 为探讨不同通用引物扩增16S rDNA靶序列对活性污泥微生物群落分析的影响,更合理的利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析活性污泥样品.从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)中获取活性污泥,以3对通用引物341f/534r、968f/1 401r和341f/926r扩增16S rDNA序列,用DGGE分离PCR扩增产物.研究表明采用不同引物对进行DGGE分析时,群落多样性和动态存在显著的差异.341f/534r和968f/1 401r的靶序列分离效果较好,341f/926r的靶序列分离效果较差.引物341f/534r和341f/926r DGGE图谱显示S2和S3相似性高,引物968f/1 401r DGGE图谱显示S1和S2相似性高.由此可见采用不同引物对进行DGGE分析时,群落结构之间的相似性和动态是不一致的.341f/534r的DGGE图谱中条带丰富,多样性最好,968f/1 401r的DGGE图谱次之,341f/926r DGGE图谱条带最少,多样性也较差.因此,在利用DGGE分析活性污泥样品时采用引物341f/534r和968f/1 401r是比较适宜的. 作 者： 邢德峰    任南琪    宋佳秀    曲敏    徐香玲    XING De-feng    REN Nan-qi    SONG Jia-xiu    QU Min    XU Xiang-ling   作者单位： 邢德峰,任南琪,宋佳秀,XING De-feng,REN Nan-qi,SONG Jia-xiu(哈尔滨工业大学市政环境工程学院,哈尔滨,150090)

曲敏,QU Min(哈尔滨师范大学生命与环境科学学院,哈尔滨,150080;哈尔滨商业大学食品工程学院,哈尔滨,150076)

徐香玲,XU Xiang-ling(哈尔滨师范大学生命与环境科学学院,哈尔滨,150080) 

期 刊： 环境科学  ISTICPKU   Journal： CHINESE JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCE  年，卷(期)： 2006, 27(7)  分类号： X172  关键词： DGGE    16S rDNA    活性污泥    群落动态    群落多样性   

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