基于PNO基因序列分析隐孢子虫种系发育关系

基于PNO基因序列分析隐孢子虫种系发育关系

本文以核基因组的功能蛋白丙酮酸:NADP+氧化还原酶(pyruvate:NADP+ oxidoreductase,PNO)编码基因作为研究对象,对本实验室分离保存的隐孢子虫虫株进行扩增测序,用ClustalX 1.81对扩增序列与GenBank相关参考序列进行比对,用Paup4.0程序中邻接法(Neighbor-joining method,NJ)、最大简约法(Parsimonv,MP)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)进行聚类分析,以确定不同隐孢子虫分离株之间的遗传进化关系,并以18S rRNA和HSP70基因构僵的基因树作参照,进而评价PNO这一基因座是否适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系分析的基因座.结果表明通过PNO构建的进化树将隐孢子虫分为2大类:Cryptosporidium bailey和C.meleagridis处于一个分枝,C.hominis、C.parvum牛基因型和C.parvum鼠基因型处于另一个分枝上.不同隐孢子虫之间的同源性介于95.0%～100%,能有效区分隐孢子虫不同基因型.因此,PNO基因序列也适合作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记.

作 者： 王进产 张龙现 赵金凤 宁长申 菅复春 WANG Jin-Chan ZHANG Long-Xian ZHAO Jin-Feng NING Chang-Shen JIAN Fu-Chun   作者单位： 王进产,WANG Jin-Chan(河南农业大学牧医工程学院,郑州,450002;洛阳普莱柯生物工程有限公司,河南洛阳,471000)

张龙现,赵金凤,宁长申,菅复春,ZHANG Long-Xian,ZHAO Jin-Feng,NING Chang-Shen,JIAN Fu-Chun(河南农业大学牧医工程学院,郑州,450002) 

刊 名： 寄生虫与医学昆虫学报  ISTIC 英文刊名： ACTA PARASITOLOGICA ET MEDICA ENTOMOLOGICA SINICA  年，卷(期)： 2008 15(1)  分类号： Q96  关键词： 隐孢子虫   丙酮酸   NADP+氧化还原酶   基因分型   种系发育关系  

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