植物SSR引物开发策略简述

植物SSR引物开发策略简述

SSR是一种优秀的分子遗传标记,已经广泛应用到遗传多样性检测、遗传种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位与标记辅助育种等多个领域.但SSR标记应用的前提是根据物种已知DNA序列设计特异引物,才能进行PCR扩增.对于大多数物种而言,目前获得的基因组DNA及表达的cDNA序列还非常有限或者根本没有.由此人们不断的设计出各种方法以开发出尽可能多的SSR引物,本文简要地介绍了基于序列数据设计和发展SSR引物的方法,这对于全基因组序列已经测序的或者已经拥有丰富DNA数据的物种是非常快捷的策略.对于那些遗传背景复杂或知之甚少或基因组数据有限的物种,本文也系统的介绍了传统的文库法、富集法等开发SSR引物的策略.进一步的本文结合本实验室的研究经验,对FIASCO磁珠富集法和ISS-抑制PCR法进行了比较.

作 者： 陈怀琼 隋春 魏建和 Chen Huaiqiong Sui Chun Wei Jianhe   作者单位： 中国医学科学院和北京协和医学院药用植物研究所,北京,100193  刊 名： 分子植物育种  英文刊名： MOLECULAR PLANT BREEDING  年，卷(期)： 2009 7(4)  分类号： Q94  关键词： SSR   引物开发策略   文库法   富集法  

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