蛋白质组研究中离子阱串联质谱数据搜库结果解释方法

蛋白质组研究中离子阱串联质谱数据搜库结果解释方法

基于离子阱串联质谱仪的鸟枪法是一种高通量的蛋白质鉴定方法.得到的数据一般使用软件SE-QUEST搜索蛋白质序列数据库,得到肽段鉴定列表以及相应的打分.为了得到蛋白质鉴定列表,还需要进行肽段鉴定结果的过滤和假阳性率的计算,然后根据肽段鉴定结果组装蛋白质列表.这两个问题目前还没有很好地解决.对已有的方法进行总结和比较,可以给搜库结果解释方法的选择提供参考,对数据质量控制方法的改进也有所帮助.

作 者： 张纪阳 朱云平 谢红卫 贺福初 ZHANG Ji-yang ZHU Yun-ping XIE Hong-wei HE Fu-chu   作者单位： 张纪阳,谢红卫,ZHANG Ji-yang,XIE Hong-wei(国防科学技术大学机电工程与自动化学院,长沙,410073)

朱云平,贺福初,ZHU Yun-ping,HE Fu-chu(军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京,100850;北京蛋白质组研究中心,北京,102206) 

刊 名： 生物物理学报  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BIOPHYSICA SINICA  年，卷(期)： 2006 22(4)  分类号： Q5  关键词： SEQUEST   离子阱串联质谱   数据质量控制   蛋白质鉴定  

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