- 相关推荐
红鳍东方鲀基因组微卫星特征分析
对河豚基因组微卫星分布特征进行研究,在约365Mb基因组序列中共找到49 647个微卫星序列,平均每隔7 351个碱基就有1个.微卫星序列长度主要分布在20～60个碱基的长度范围内.全部微卫星序列重复区长度(2 802 374bp)占整个基因组的比例为0.77%.两碱基重复类型数目最多,为35 339个,占总数的71.30%;其次是四碱基类型,6 837个,占13.77%;再次分别是三碱基类型3 548个,占7.14%,五碱基类型1 856个,占3.73%,六碱基类型1 605个,占3.23%,单碱基类型最少,共402个,占0.80%.按降序排列,出现最多的前20个微卫星重复类别为:CA, TG, GT, AC, GA, CT, TC, TA, AG, AT, TCCA, ATCC, TCTG, GATG, ATCT, CATC, TGGA, ATGG, GATA, GAG,占全部微卫星序列的75.21%.在河豚基因组中未发现GC微卫星序列的存在.与其它生物基因组中微卫星分布特征相比,河豚基因组具有更高的简洁性.本研究将为研究河豚微卫星标记、研究其群体遗传多样性,进行不同基因组的比较研究提供基础.
作 者： 崔建洲 申雪艳 杨官品 宫庆礼 顾谦群 CUI Jian-Zhou SHEN Xue-Yan YANG Guan-Pin GONG Qing-Li GU Qian-Qun 作者单位： 中国海洋大学生命科学与技术学部,山东,青岛,266003 刊 名： 中国海洋大学学报（自然科学版） ISTIC PKU 英文刊名： PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA 年，卷(期)： 2006 36(2) 分类号： Q754 关键词： 红鳍东方鲀(Takifugu rubripes) 微卫星 基因组【红鳍东方鲀基因组微卫星特征分析】相关文章：
SC2018-2004《红鳍东方鲀》标准中关于体长与体重关系的问题值得推敲04-27
松杨栅锈菌的ITS序列和微卫星分析04-27
东方红交响曲04-27
连续近交下家猪微卫星基因组杂合度与经济性状的相关性研究04-26
基因组DNA提取方法及试剂的对比分析04-26
向来的语义语用特征分析04-26
温室养殖暗纹东方鲀毛霉菌的鉴定、致病性和病理学研究04-26
孙家栋与东方红1号04-26
五个山羊群体微卫星标记的遗传多样性分析04-26
洪灾综合风险的结构特征分析04-26